Újgenerációs szekvenálás
A következő generációs szekvenálás (NGS) egy olyan kifejezés, amely tágan értelmezve számos kapcsolódó technológiát foglal magában, amelyek lehetővé teszik egy szervezet kiválasztott régiójának vagy teljes genomjának tömegesen párhuzamos vagy mély szekvenálási lefedettségét. A genomikai alapú kutatások tudományágán belül nélkülözhetetlen szekvenálási technológiák már évtizedek óta léteznek. Az NGS vagy a tömegesen párhuzamos DNS- és RNS-szekvenálási technológiák folyamatos fejlődése azonban a kutatók számára az egész genomra kiterjedő szekvenálási lefedettség és az adatelemző eszközök növekedését biztosította, miközben a költségek gyorsan csökkentek. Az NGS alkalmazásai túlmutatnak a teljes genom analízisén, mivel jelentős hatással van az alapvető genomikai és a betegségkutatás legújabb eredményeire egyaránt.
Kiemelt kategóriák
Agaróz bioreagensek a sejtkultúra és a molekuláris biológia alkalmazásaihoz, kész agaróz géleket kínálnak RNS/DNS elektroforézishez.
Körű bélmikrobiom-elemzés: Fedezzen fel egy holisztikus megoldást, amely magában foglalja a minta előkészítését, a szekvenálást, a bioinformatikát és a statisztikát. A 16S-től a WGS-ig.
NGS-módszerek áttekintése
Míg az NGS módszertana és reagensek folyamatosan fejlődnek, ma már számos NGS-rendszer áll a kutatók rendelkezésére. Az általánosan használt platformok az NGS munkafolyamat több kritikus lépését foglalják magukban, beleértve a minta- vagy könyvtár-előkészítést, a fürtgenerálást, a szekvenálást és az adatelemzést. A mintaelőkészítés jellemzően DNS-amplifikációt vagy szekvencia-linkerek vagy adaptorok hozzáadását jelenti. Az egyes DNS-szekvenciák klasztergenerálása akkor történik, amikor a kovalensen kapcsolt linkert tartalmazó DNS hibridizálódik egy szilárd felületre a híd PCR-amplifikációhoz, vagy alternatív módszerekkel, például emulziós PCR-rel. Ezenkívül számos DNS-szekvenálási módszer létezik, beleértve a ligálással történő szekvenálást, a szintézissel történő szekvenálást, a piroszekvenálást és az ionos félvezető szekvenálást. Minden egyes szekvenálási módszer különböző reakciólépéseket és kémiai eljárásokat foglal magában, amelyek végső soron meghatározzák az egyes szekvenciák hosszát (olvasási hossz), a hibaarányt és a reagensköltségeket.
Analitikai megközelítések az NGS-adatok elemzéséhez
Az összes NGS-munkafolyamat utolsó eleme a szekvenálást követő kritikus adatelemzési lépés. Míg minden NGS-platform és munkafolyamat hatalmas mennyiségű, számítógépen rögzített digitális információt állít elő, a nyers adathalmazt bioinformatikusoknak kell elemezniük, akik a folyamatosan növekvő számú analitikai eszközt használnak a leolvasások összehangolására és leképezésére, mint például a Bowtie, a Galaxy és sok más. Az NGS-technológiák területén elért számos fejlesztés számos tudományterület egyesüléséből származik, amelyek célja az ilyen nagy adathalmazok elemzésének és értelmezésének fejlesztése és optimalizálása. A konkrét alkalmazási igényektől függően a kutatók ma már teljes genomok, exomok vagy transzkriptomok szekvenálására használhatják ezeket a nagy teljesítményű eszközöket az alap- és betegségkutatási vizsgálatokhoz.
Látogasson el dokumentumkeresőnkbe adatlapok, tanúsítványok és műszaki dokumentációk kereséséhez.
Kapcsolódó cikkek
- Az újgenerációs szekvenálási (NGS) platformtól függetlenül univerzális és index adapterszekvenciákra van szükség a mintadarabok megfelelő összeállításához.
- MISSION siRNA Negative Controls ensure mRNA knockdown efficiency baseline; tested in human, rat, and mouse cells, designed without gene homology.
- MISSION Positive Control siRNA, validated for siRNA silencing experiments, saves time in gene silencing research.
- Improve NGS performance and reliability by optimizing water quality at every step of the workflow, from fragmentation to cleaning to sequencing.
- Mindent látni (20)
Kapcsolódó protokollok
- Az izzítás két egyszálú, komplementer szekvenciájú oligonukleotid melegítésének és hűtésének folyamata.
- SeqPlex DNA Amplification Kit enables NGS from small or degraded DNA quantities for whole genome amplification.
- The SeqPlex RNA Amplification kit provides a method for amplification of total RNA or isolated mRNA prior to entry into the workflows of the commonly used deep sequencing platforms.
- GenomePlex® is a Whole Genome Amplification (WGA) method that allows the researcher to generate a representative amplification of genomic DNA
- WTA2, a Whole Transcriptome Amplification (WTA) method, allows for representative amplification of nanogram quantities of total RNA in less than 4 hours without 3-bias
- Mindent látni (6)
További cikkek és protokollok keresése
Hogyan tudunk segíteni
Kérdés esetén kérjük, küldjön ügyféltámogatási kérelmet
vagy beszéljen ügyfélszolgálatunkkal:
Emailt küldjön custserv@sial.com
vagy hívja a +1 (800) 244-1173-as telefonszámot
További támogatás
- Chromatogram Search
Use the Chromatogram Search to identify unknown compounds in your sample.
- Számológépek és alkalmazások
Web Toolbox - tudományos kutatási eszközök és források az analitikai kémia, az élettudomány, a kémiai szintézis és az anyagtudomány számára.
- Customer Support Request
Ügyfélszolgálat, beleértve a megrendelésekkel, termékekkel, számlákkal és a weboldal technikai kérdéseivel kapcsolatos segítséget.
- FAQ
Explore our Frequently Asked Questions for answers to commonly asked questions about our products and services.