Microbioma

Il termine "microbioma" indica l'insieme dei genomi o del materiale genetico di tutti i microbi presenti in un determinato ambiente, denominato "microbiota". Il microbioma umano descrive l'insieme dei microbiomi presenti nel corpo umano, che risiedono principalmente nell'intestino e che variano notevolmente da un individuo all'altro e tra le diverse sedi anatomiche. Tra i fattori che possono influenzare il microbioma figurano l'alimentazione, lo stile di vita, la genetica, la sede anatomica, gli antibiotici e gli agenti patogeni.
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Ricerca sul microbioma
Nel campo emergente della ricerca sul microbioma, gli scienziati devono affrontare la sfida di identificare e caratterizzare microbi sconosciuti che possono risultare difficili da isolare, coltivare e studiare. Le applicazioni delle analisi del microbioma umano, animale e ambientale hanno il potenziale di portare alla scoperta di nuovi prodotti terapeutici e naturali. I nostri scienziati stanno creando nuove soluzioni per aiutarvi a coltivare e/o identificare i microbi per la caratterizzazione delle comunità microbiche.
Per favorire la scoperta di nuovi microbi, offriamo:
- MetaPolyzme per la digestione di microbi difficili e l’isolamento del DNA totale
- Enzimi privi di DNA per analisi prive di contaminazione
- Anticorpi altamente specifici per batteri e componenti batterici
- Standard di DNA singoli e batteri inattivati per evitare distorsioni e aumentare la riproducibilità
Terreni
di coltura microbici
I microrganismi presentano esigenze nutrizionali diverse, metabolismi differenti, sono inibiti da composti diversi e spesso possono essere rilevati solo utilizzando sistemi indicatori specifici. I terreni selettivi consentono la crescita solo di determinate specie o ceppi con caratteristiche specifiche, mentre i terreni di coltura non selettivi favoriscono la crescita di un'ampia gamma di organismi. I terreni dotati di un sistema di differenziazione possono essere utilizzati per identificare o almeno per differenziare i microrganismi gli uni dagli altri. Per la caratterizzazione delle comunità microbiche e la preparazione del DNA, offriamo un’ampia gamma di terreni di coltura microbici e materie prime.
Standard per il microbioma
La tecnologia di sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha facilitato il sequenziamento di grandi volumi di DNA microbico, consentendo l’analisi di campioni complessi di microbioma. Per evitare distorsioni e garantire la riproducibilità nell’analisi del microbioma, la standardizzazione è fondamentale. La standardizzazione è la chiave per il futuro della ricerca sul microbioma e metagenomica, in grado di generare dati accurati e validi.
Offriamo un elenco in continua espansione di standard per il microbioma, costituiti da DNA microbico singolo e batteri inattivati, adatti alla PCR, al sequenziamento e all’NGS. Questi standard singoli, pratici e pronti all’uso, aggiungono valore fornendo un controllo specifico e personalizzato. Questi standard economici supportano i flussi di lavoro di microbiomica o metagenomica aumentando la riproducibilità e consentendo un confronto affidabile dei risultati con quelli di altri laboratori.
Anticorpi per la ricerca sul microbioma
Il nostro portafoglio di anticorpi per l’analisi del microbioma comprende anticorpi altamente specifici che si legano a batteri o a componenti batterici (ad es. tossine, proteine specifiche e lipopolisaccaridi), adatti a diverse applicazioni per il rilevamento e l’isolamento di batteri specifici. Le principali applicazioni di immunorilevamento includono ELISA, Western blot (WB), imaging e isolamento.
Enzimi litici privi di DNA per la ricerca sul microbioma
Lo studio delle comunità microbiche ha subito una rivoluzione negli ultimi anni grazie alla diffusione di tecniche analitiche indipendenti dalla coltura, quali il sequenziamento del gene 16S rRNA e la metagenomica. Poiché la contaminazione da DNA durante la preparazione dei campioni rappresenta un fattore di confondimento significativo per questi approcci basati sul sequenziamento, sono essenziali reagenti per l’estrazione del DNA privi di contaminanti di DNA. Un’altra sfida importante nel trattamento dei campioni del microbioma è rappresentata dalla difficoltà di disgregare i microbi: le pareti cellulari possono formare capsule o spore resistenti durante la lavorazione. Il DNA può essere estratto dai microbi utilizzando enzimi lisanti per indurre la formazione parziale di sferoplasti. Questi sferoplasti vengono successivamente lisati per rilasciare il DNA. Gli enzimi litici purificati sono sottoposti a rigorosi test di controllo qualità per garantire che siano privi di contaminanti di DNA e, pertanto, adatti alla ricerca sul microbioma.
Kit per la purificazione del DNA del microbioma
Per studiare il ruolo del microbiota nella salute umana, animale e ambientale, è necessario ottenere dati microbici accurati e riproducibili. È quindi fondamentale applicare una metodologia appropriata per l’estrazione del DNA microbico. La definizione della procedura ottimale di isolamento del DNA è fondamentale per la robustezza e la riproducibilità dei risultati, poiché un’estrazione inefficace del DNA può portare a una caratterizzazione errata della comunità microbica. I nostri kit per la purificazione del DNA offrono metodi pratici e rapidi per isolare DNA microbico di alta qualità e ad alto rendimento da campioni diversi.
Risorse correlate
- Articolo: Enzimi lisanti
Enzymatic cell lysis and protoplast prep processes demystified, revealing complex enzymatic reactions during sample preparation.
- Articolo: Standard relativi al DNA per la ricerca metagenomica sulle comunità del microbioma
DNA standards enhance metagenomics research integrity, offering precise species study and mixed community standards.
- Protocol Guide: Generation of Apical-Out Gastrointestinal Organoids
Step-by-step protocol for generating apical-out human gut organoids for microbiome, ADME/Tox, viral and gastrointestinal related disease research. See the complete organoid culture protocol.
- Articolo: MetaPolyzyme, enzimi per la lisi cellulare senza DNA destinati ai flussi di lavoro sul microbioma
Explore the benefits of MetaPolyzyme, DNA free to improve DNA extraction and increase the number of taxa identified in treated samples.
- Articolo: Benzonase® Nuclease per i flussi di lavoro relativi al microbioma
Benzonase® Nuclease per la riduzione del DNA dell’ospite nei flussi di lavoro relativi al microbioma e per migliorare l’identificazione dei taxa.