Mikrobioma

Mikrobioma merujuk pada kumpulan genom atau materi genetik dari semua mikroba dalam suatu lingkungan tertentu, yang disebut mikrobiota. Mikrobioma manusia menggambarkan kumpulan mikrobioma dalam tubuh manusia yang sebagian besar berada di saluran pencernaan, dan yang bervariasi secara signifikan dari satu individu ke individu lain serta di antara berbagai lokasi anatomi. Faktor-faktor yang dapat memengaruhi mikrobioma antara lain pola makan, gaya hidup, genetika, lokasi anatomi, antibiotik, dan patogen.
Products
Penelitian Mikrobioma
Di bidang penelitian mikrobioma yang sedang berkembang, para ilmuwan dihadapkan pada tantangan untuk mengidentifikasi dan mengkarakterisasi mikroba yang belum dikenal, yang seringkali sulit diisolasi, dikultur, dan diteliti. Penerapan analisis mikrobioma manusia, hewan, dan lingkungan berpotensi mengarah pada penemuan produk terapeutik dan produk alami baru. Para ilmuwan kami sedang mengembangkan solusi baru untuk membantu Anda mengkultur dan/atau mengidentifikasi mikroba guna mengkarakterisasi komunitas mikroba.
Untuk memfasilitasi penemuan mikroba baru, kami menawarkan:
- MetaPolyzme untuk pencernaan mikroba yang sulit dan isolasi DNA total
- Enzim bebas DNA untuk analisis bebas kontaminasi
- Antibodi yang sangat spesifik terhadap bakteri dan komponen bakteri
- Standar DNA individual dan bakteri yang telah dinonaktifkan untuk menghindari bias dan meningkatkan reproduktifitas
Media
Mikroba
Mikroorganisme memiliki kebutuhan nutrisi yang beragam, metabolisme yang berbeda-beda, terhambat oleh senyawa yang berbeda, dan seringkali hanya dapat dideteksi menggunakan sistem indikator spesifik. Media selektif memungkinkan pertumbuhan hanya spesies atau strain tertentu dengan atribut spesifik, sedangkan media kultur nonselektif mendorong pertumbuhan berbagai macam organisme. Media dengan sistem diferensiasi dapat digunakan untuk mengidentifikasi atau setidaknya membedakan mikroorganisme satu sama lain. Untuk karakterisasi komunitas mikroba dan persiapan DNA, kami menawarkan beragam media mikroba dan bahan baku.
Standar Mikrobioma
Teknologi Next Generation Sequencing (NGS) telah memfasilitasi pengurutan DNA mikroba dalam volume besar, sehingga memungkinkan analisis sampel mikrobioma yang kompleks. Untuk menghindari bias dan mencapai reproduktifitas dalam analisis mikrobioma, standarisasi sangatlah penting. Standarisasi merupakan kunci bagi masa depan penelitian mikrobioma dan metagenomik yang dapat menghasilkan data yang akurat dan valid.
Kami menawarkan daftar yang terus bertambah dari standar mikrobioma berupa DNA mikroba individu dan bakteri yang telah dinonaktifkan, yang cocok untuk PCR, pengurutan, dan NGS. Standar individu yang praktis dan siap pakai ini memberikan nilai tambah dengan menyediakan kontrol yang spesifik dan disesuaikan. Standar yang ekonomis ini mendukung alur kerja mikrobiomik atau metagenomik dengan meningkatkan reproduktibilitas dan memungkinkan perbandingan hasil yang andal dari laboratorium lain.
Antibodi untuk Penelitian Mikrobioma
Portofolio antibodi kami untuk analisis mikrobioma mencakup antibodi yang sangat spesifik yang mengikat bakteri atau komponen bakteri (misalnya toksin, protein unik, dan lipopolisakarida), yang cocok untuk berbagai aplikasi dalam mendeteksi dan mengisolasi bakteri tertentu. Aplikasi deteksi imunologi utama meliputi ELISA, Western blot (WB), pencitraan, dan isolasi.
Enzim Lisis Bebas DNA untuk Penelitian Mikrobioma
Studi tentang komunitas mikroba telah mengalami revolusi dalam beberapa tahun terakhir berkat adopsi luas teknik analitis tanpa kultur, seperti sekuensing gen 16S rRNA dan metagenomik. Karena kontaminasi DNA selama persiapan sampel merupakan faktor pengganggu signifikan dalam pendekatan berbasis sekuensing ini, reagen ekstraksi DNA yang bebas dari kontaminan DNA sangatlah penting. Tantangan utama lainnya dalam pengolahan sampel mikrobioma adalah sulitnya menghancurkan mikroba – dinding sel dapat membentuk kapsul atau spora yang resisten saat diproses. DNA dapat diekstraksi dari mikroba dengan menggunakan enzim lisis untuk memicu pembentukan spheroplast parsial. Spheroplast ini kemudian dilisis untuk melepaskan DNA. Enzim lisis yang telah dimurnikan menjalani pengujian kontrol kualitas yang ketat untuk memastikan bebas dari kontaminan DNA, dan karenanya cocok untuk penelitian mikrobioma.
Kit Pemurnian DNA Mikrobioma
Untuk mempelajari peran mikrobiota dalam kesehatan manusia, hewan, dan lingkungan, data mikroba yang akurat dan dapat direproduksi harus diperoleh. Oleh karena itu, sangat penting untuk menerapkan metodologi yang tepat dalam ekstraksi DNA mikroba. Menetapkan prosedur isolasi DNA yang optimal sangat krusial untuk ketahanan dan reproduktibilitas hasil, karena ekstraksi DNA yang tidak efektif dapat mengakibatkan karakterisasi yang keliru terhadap komunitas mikroba. Kit pemurnian DNA kami menyediakan metode yang praktis dan cepat untuk mengisolasi DNA mikroba berkualitas tinggi dan dengan hasil yang melimpah dari berbagai sampel.
Sumber Daya Terkait
- Artikel: Enzim Lisis
Enzymatic cell lysis and protoplast prep processes demystified, revealing complex enzymatic reactions during sample preparation.
- Artikel: Standar DNA untuk Penelitian Metagenomik terhadap Komunitas Mikrobioma
DNA standards enhance metagenomics research integrity, offering precise species study and mixed community standards.
- Protocol Guide: Generation of Apical-Out Gastrointestinal Organoids
Step-by-step protocol for generating apical-out human gut organoids for microbiome, ADME/Tox, viral and gastrointestinal related disease research. See the complete organoid culture protocol.
- Artikel: MetaPolyzyme, Enzim Lisis Sel Tanpa DNA untuk Alur Kerja Mikrobioma
Explore the benefits of MetaPolyzyme, DNA free to improve DNA extraction and increase the number of taxa identified in treated samples.
- Artikel: Benzonase® Nuklease untuk Alur Kerja Mikrobioma
Benzonase® Nuclease untuk mengurangi DNA inang dalam alur kerja mikrobioma dan meningkatkan identifikasi takson.