การคัดกรองการทำงานด้านจีโนมิก

ความก้าวหน้าในการแก้ไขยีน, การปิดเสียงยีน, การปรับยีน, การจัดลำดับรุ่นถัดไป (NGS) และเทคโนโลยีการคัดกรองฟีโนไทป์ช่วยให้การทำงานของหน้าจอจีโนมิกที่ทำงานได้อย่างมีประสิทธิภาพในระบบรุ่นที่หลากหลาย

• การรบกวน RNA (RNAi): สามารถใช้ตัวทำปฏิกิริยา RNAi หลายประเภทสำหรับการปิดเสียงยีนรวมถึง RNA แบบเกลียวคู่ยาว (DSRNA) สังเคราะห์ RNA รบกวนขนาดเล็ก (siRNA) และ RNA กิ๊บสั้น (shRNA) ตัวทำปฏิกิริยา RNAi เหล่านี้จะถูกนำไปใช้กับเซลล์โดยการถ่ายโอนโดยตรงของปัจจัยการปรับ (siRNAs และ dsRNAs) โดยการถ่ายโอนดีเอ็นเอเข้ารหัส shRNA ที่ขับเคลื่อนด้วยโปรโมเตอร์หรือโดยวิธีการถ่ายโอนไวรัสโดยใช้โครงสร้าง lentiviral ที่มีตลับ shRNA โคลน สามารถใช้ dsRNA และ siRNA ในหน้าจอแบบ arrayed สำหรับการคัดกรองปริมาณงานสูงในขณะที่ shRNA สามารถนำไปใช้กับประชากรเซลล์ในหน้าจอแบบ arrayed หรือ pooled สำหรับการวิเคราะห์ปริมาณงานสูงโดยมีหน้าจอแบบรวมโดยใช้การจัดลำดับรุ่นถัดไป (NGS) สำหรับการลดปริมาณ
• ระบบ CRISPR (clustered เป็นประจำ interspaced palindromic สั้นซ้ำ) สามารถใช้ในการจัดการจีโนม transcriptomes และ epigenomes ของเซลล์เลี้ยงลูกด้วยนม ในการแก้ไขยีน CRISPR-Cas9 จะมีการกำหนดเป้าหมายให้กับ Locus เฉพาะโดยใช้ RNA คู่มือ CRISPR สามารถใช้เพื่อปิดเสียงการผลิตทรานสคริปท์โดยการแนะนำการกลายพันธุ์แบบ frameshift การกดซ้ำเครื่องจักรทรานสคริปต์การสรรหาปัจจัยการถอดสคริปต์เพื่อเปิดใช้งานการแสดงออกการกระตุ้นการกลายพันธุ์ของจุดเป้าหมายหรือการปรับเปลี่ยนเครื่องหมาย epigenetic คล้ายกับ RNAi CRISPR สามารถนำมาใช้โดยตรงเป็นคอมเพล็กซ์ RNP ในหน้าจอที่เป็นอาร์เรย์หรือเป็นดีเอ็นเอ plasmid หรือ lentivirus สำหรับการใช้งานการคัดกรองทั้งแบบรวมและแบบ arrayed CRISPR Pools, Library และ Arrays ช่วยอำนวยความสะดวกในการคัดกรองยีนที่มีความหลากหลายสูงและมีประสิทธิภาพสูงสำหรับการวิเคราะห์การทำงาน การตรวจคัดกรองการปรับสัญญาณพันธุกรรมยังเป็นไปได้ด้วยระบบ CRISPR ที่ปราศจากนิวไคลน์ที่ใช้ dCas9 ที่ไม่ใช้งานด้วยเอนไซม์รวมกับตัวทำสำเนาแบบ Transcriptional ที่เปิดใช้งาน (CRISPRA) หรือยับยั้งการถอดยีน (CRISPRI) ซึ่งนำไปสู่การเพิ่มหรือลดการแสดงออกของยีน