Hệ vi sinh vật

Hệ vi sinh vật (microbiome) là thuật ngữ chỉ tổng thể các bộ gen hoặc vật liệu di truyền của tất cả các vi sinh vật trong một môi trường cụ thể, được gọi là hệ vi sinh (microbiota). Hệ vi sinh vật của con người mô tả tổng thể các hệ vi sinh vật trong cơ thể người, chủ yếu cư trú trong đường ruột, và có sự khác biệt đáng kể giữa các cá nhân cũng như giữa các vị trí giải phẫu khác nhau. Các yếu tố có thể ảnh hưởng đến hệ vi sinh vật bao gồm chế độ ăn uống, lối sống, yếu tố di truyền, vị trí giải phẫu, kháng sinh và các tác nhân gây bệnh.
Products
Nghiên cứu về hệ vi sinh vật
Trong lĩnh vực nghiên cứu hệ vi sinh vật đang phát triển, các nhà khoa học đang đối mặt với thách thức trong việc xác định và mô tả các vi sinh vật chưa được biết đến, vốn thường khó tách biệt, nuôi cấy và nghiên cứu. Ứng dụng phân tích hệ vi sinh vật của con người, động vật và môi trường có tiềm năng dẫn đến việc phát hiện ra các sản phẩm điều trị và sản phẩm tự nhiên mới. Các nhà khoa học của chúng tôi đang phát triển các giải pháp mới để hỗ trợ quý vị trong việc nuôi cấy và/hoặc xác định vi sinh vật nhằm mô tả các cộng đồng vi sinh vật.
Để hỗ trợ việc phát hiện các vi sinh vật mới, chúng tôi cung cấp:
- MetaPolyzme để phân giải các vi sinh vật khó xử lý và phân lập DNA tổng hợp
- Enzyme không chứa DNA để phân tích không bị nhiễm bẩn
- Kháng thể có độ đặc hiệu cao đối với vi khuẩn và các thành phần của vi khuẩn
- Các tiêu chuẩn DNA riêng lẻ và vi khuẩn đã bị bất hoạt để tránh sai lệch và tăng tính lặp lại
Môi trường
nuôi cấy vi sinh vật
Vi sinh vật có nhu cầu dinh dưỡng đa dạng, quá trình trao đổi chất khác nhau, bị ức chế bởi các hợp chất khác nhau và thường chỉ có thể được phát hiện bằng các hệ thống chỉ thị cụ thể. Môi trường chọn lọc chỉ cho phép sự phát triển của một số loài hoặc chủng nhất định có các đặc tính cụ thể, trong khi môi trường nuôi cấy không chọn lọc thúc đẩy sự phát triển của một loạt các sinh vật. Môi trường có hệ thống phân biệt có thể được sử dụng để xác định hoặc ít nhất là phân biệt các vi sinh vật với nhau. Để đặc trưng hóa cộng đồng vi sinh vật và chuẩn bị DNA, chúng tôi cung cấp một loạt các môi trường nuôi cấy vi sinh vật và nguyên liệu thô.
Tiêu chuẩn vi sinh vật
Công nghệ Giải trình tự Thế hệ Mới (NGS) đã tạo điều kiện thuận lợi cho việc giải trình tự DNA vi sinh vật với khối lượng lớn, cho phép phân tích các mẫu hệ vi sinh phức tạp. Để tránh sai lệch và đảm bảo tính tái hiện trong phân tích hệ vi sinh, việc tiêu chuẩn hóa là vô cùng quan trọng. Tiêu chuẩn hóa là chìa khóa cho tương lai của nghiên cứu hệ vi sinh và metagenomics, giúp tạo ra dữ liệu chính xác và đáng tin cậy.
Chúng tôi cung cấp danh mục ngày càng phong phú các tiêu chuẩn vi sinh vật gồm DNA vi sinh vật riêng lẻ và vi khuẩn bất hoạt, phù hợp cho PCR, giải trình tự và NGS. Các tiêu chuẩn riêng lẻ tiện lợi, sẵn sàng sử dụng này mang lại giá trị gia tăng bằng cách cung cấp một kiểm soát cụ thể, được tùy chỉnh. Các tiêu chuẩn kinh tế này hỗ trợ quy trình làm việc về vi sinh vật học hoặc metagenomics bằng cách tăng tính tái hiện và cho phép so sánh đáng tin cậy kết quả từ các phòng thí nghiệm khác.
Kháng thể cho nghiên cứu hệ vi sinh vật
Danh mục kháng thể của chúng tôi dành cho phân tích hệ vi sinh vật bao gồm các kháng thể có độ đặc hiệu cao, liên kết với vi khuẩn hoặc các thành phần của vi khuẩn (ví dụ: độc tố, protein đặc trưng và lipopolysaccharide), phù hợp với nhiều ứng dụng khác nhau để phát hiện và phân lập các vi khuẩn cụ thể. Các ứng dụng phát hiện miễn dịch chính bao gồm ELISA, Western blot (WB), hình ảnh và phân lập.
Enzyme phân giải không chứa DNA cho nghiên cứu hệ vi sinh vật
Nghiên cứu về các cộng đồng vi sinh vật đã được cách mạng hóa trong những năm gần đây nhờ việc áp dụng rộng rãi các kỹ thuật phân tích không cần nuôi cấy như giải trình tự gen 16S rRNA và metagenomics. Do ô nhiễm DNA trong quá trình chuẩn bị mẫu là một yếu tố gây nhiễu đáng kể đối với các phương pháp dựa trên trình tự này, các chất phản ứng chiết xuất DNA không chứa tạp chất DNA là điều cần thiết. Một thách thức lớn khác trong việc xử lý mẫu hệ vi sinh vật là vi sinh vật rất khó bị phá vỡ – thành tế bào có thể hình thành các nang hoặc bào tử kháng khi được xử lý. DNA có thể được chiết xuất từ vi sinh vật bằng cách sử dụng các enzym phân giải để kích thích sự hình thành một phần các tế bào hình cầu. Các tế bào hình cầu này sau đó được phân giải để giải phóng DNA. Các enzym phân giải tinh khiết phải trải qua các thử nghiệm kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt để đảm bảo chúng không chứa tạp chất DNA, và do đó phù hợp cho nghiên cứu hệ vi sinh vật.
Bộ dụng cụ tinh chế DNA vi sinh vật
Để nghiên cứu vai trò của hệ vi sinh vật đối với sức khỏe con người, động vật và môi trường, cần thu được dữ liệu vi sinh chính xác và có thể tái hiện. Do đó, việc áp dụng phương pháp chiết xuất DNA vi sinh phù hợp là vô cùng quan trọng. Thiết lập quy trình tách chiết DNA tối ưu là yếu tố then chốt để đảm bảo độ tin cậy và khả năng tái hiện của kết quả, vì việc chiết xuất DNA không hiệu quả có thể dẫn đến việc mô tả sai lệch về cộng đồng vi sinh vật. Các bộ kit tinh chế DNA của chúng tôi cung cấp các phương pháp thuận tiện và nhanh chóng để tách chiết DNA vi sinh vật chất lượng cao và năng suất cao từ các mẫu đa dạng.
Tài nguyên liên quan
- Bài viết: Các enzym phân giải
Enzymatic cell lysis and protoplast prep processes demystified, revealing complex enzymatic reactions during sample preparation.
- Bài báo: Các tiêu chuẩn về DNA trong nghiên cứu metagenomics về các cộng đồng vi sinh vật
DNA standards enhance metagenomics research integrity, offering precise species study and mixed community standards.
- Protocol Guide: Generation of Apical-Out Gastrointestinal Organoids
Step-by-step protocol for generating apical-out human gut organoids for microbiome, ADME/Tox, viral and gastrointestinal related disease research. See the complete organoid culture protocol.
- Bài viết: MetaPolyzyme – Các enzym ly giải tế bào không chứa DNA dành cho quy trình phân tích hệ vi sinh vật
Explore the benefits of MetaPolyzyme, DNA free to improve DNA extraction and increase the number of taxa identified in treated samples.
- Bài viết: Enzyme phân giải DNA Benzonase® trong các quy trình nghiên cứu hệ vi sinh vật
Enzyme nuclease Benzonase® dùng để giảm lượng DNA của vật chủ trong các quy trình phân tích hệ vi sinh vật và nâng cao hiệu quả xác định phân loại sinh vật.